ส่วนใหญ่กายวิภาคของอวัยวะเพศชายค่อนข้างตรงไปตรงมา โครงสร้างพื้นฐานของอวัยวะเพศชายคือ corpora cavernosa ซึ่งเป็นฐานของอวัยวะเพศพร้อมกับ corpus spongiosum ซึ่งเป็นส่วนกระเปาะที่ห้อยออกมาจาก corpora cavernosa โครงสร้างที่สำคัญถัดไปในร่างกายที่มีความสำคัญเมื่อคิดถึงกายวิภาคของอวัยวะเพศชายคือ corpora bulbosa ที่จับคู่ซึ่งเป็นโครงสร้างที่เป็นรูพรุนที่ด้านบนของอวัยวะเพศชาย

ดังที่แสดงในแผนภาพนี้แสดงให้เห็นถึงกายวิภาคของอวัยวะเพศชายขั้นพื้นฐานโครงสร้างสำคัญในเนื้อเยื่ออวัยวะเพศที่สำคัญซึ่งประกอบเป็นอวัยวะเพศชายคือ corpora cavernosa และหลอดไฟ corpora ซึ่งทั้งสองมีส่วนช่วยในกายวิภาคของอวัยวะเพศชายโดยรวมเมื่อพิจารณาจากลักษณะทางกายวิภาคของอวัยวะเพศชาย ในทั้งสองนั้น corpora bulbosa นั้นหนากว่าและเป็นส่วนที่สำคัญที่สุดของอวัยวะเพศเมื่อพูดถึงกายวิภาคของอวัยวะเพศชาย

ขนาดอวัยวะเพศยังถูกกำหนดโดยกายวิภาคของอวัยวะเพศชาย ความยาวของอวัยวะเพศส่วนใหญ่พิจารณาจากความยาวของ corpora cavernosa เนื่องจากเป็นตัวกำหนดความยาวของเพลาที่ยื่นออกมาจาก corpora cavernosa ไปยังส่วนปลายของอวัยวะเพศที่แข็งตัว ในแง่ของความหนา corpora bulbosa นั้นบางกว่า corpora cavernosa มากและด้วยเหตุนี้จึงกำหนดความหนาของอวัยวะเพศที่แข็งตัว เป็นผลให้อวัยวะเพศชายที่แข็งตัวถึงส่วนบนสุดของบริเวณหัวหน่าวจะไม่หนาเท่ากับอวัยวะเพศชายที่มีลักษณะทางกายวิภาคของอวัยวะเพศที่หนากว่า ขนาดของอวัยวะเพศยังขึ้นอยู่กับความหนาของอวัยวะเพศที่แข็งตัวและขนาดและเส้นรอบวงของอวัยวะเพศที่แข็งตัวด้วยเช่นกัน

เมื่อพิจารณาถึงการแข็งตัวของอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวทั้ง corpora cavernosa และ corpora bulb จะประกอบกันเป็นอวัยวะเพศที่แข็งตัวและด้วยเหตุนี้กายวิภาคของอวัยวะเพศชายที่แข็งตัว อวัยวะเพศชายที่แข็งตัวประกอบด้วยทั้ง corpora cavernosa และ corpora bulb และการแข็งตัวของโครงสร้างเหล่านี้จะเป็นตัวกำหนดคุณภาพของการแข็งตัว

เนื่องจากอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวประกอบด้วยทั้ง corpora cavernosa และ corpora bulb ซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของกายวิภาคของอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวโครงสร้างเหล่านี้จึงจำเป็นต้องยึดเข้าด้วยกันโดยเอ็นหรือเนื้อเยื่อที่เรียกว่าเอ็นของ corpus spongiosum เนื้อเยื่อเหล่านี้เป็นพื้นฐานของกายวิภาคของอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวและมีหน้าที่ในการยึดเนื้อเยื่ออวัยวะเพศชายที่แข็งตัวเข้าด้วยกัน เนื้อเยื่ออวัยวะเพศชายนี้มีความสำคัญต่ออวัยวะเพศชายที่แข็งตัวเนื่องจากเอ็นยึดอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวอยู่ในตำแหน่งกึ่งแข็งตัวระหว่างการแข็งตัว อวัยวะเพศชายที่แข็งตัวจะอยู่ในตำแหน่งกึ่งตั้งตรงโดยเอ็นของคอร์ปัสสปองจิโอซัม

เมื่อมองไปที่อวัยวะเพศชายที่แข็งตัวสิ่งสำคัญคือต้องจำไว้ว่า corpus spongiosum และ corpora bulbosa ก็ประกอบกันเป็นอวัยวะเพศที่แข็งตัวด้วย corpus spongiosum เป็นเอ็นบาง ๆ ที่ต่อจากส่วนหัวของอวัยวะเพศชายไปยังฐานของอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวและให้การสนับสนุนที่มั่นคงสำหรับอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวเมื่อแข็งตัว ในทำนองเดียวกัน corpora bulbosa เป็นเนื้อเยื่อที่มีรูพรุนหนาซึ่งยึดอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวเมื่อแข็งตัว

หลังจากที่คอร์ปัสสปองจิโอซัมมีโครงสร้างอีกสองอย่างที่เข้ามามีบทบาทในการสร้างอวัยวะเพศชาย โครงสร้างเหล่านี้คือ corpus spongiosum arterioles หลอดเลือดแดงเหล่านี้เชื่อมต่อ corpus spongiosum กับหลอด corpora และ corpus spongiosum venules สถานที่เหล่านี้เป็นโครงสร้างที่ช่วยขยาย corpora cavernosa และ corpora bulbosa รวมกันเป็น corpora cavernosa arterioles

อวัยวะเพศชาย spongiosum arterioles และ corpora spongiosum arterioles เป็นโครงสร้างที่ประกอบขึ้นเป็นอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวและหน้าที่ของมันคือการขยายโพรงคอร์โปราเมื่อแข็งตัวและเมื่ออวัยวะเพศแข็งตัวแข็งตัว โครงสร้างทั้งสองนี้ประกอบเป็นกายวิภาคของอวัยวะเพศชายที่แข็งตัวและโครงสร้างเหล่านี้ก่อให้เกิดลักษณะทางกายวิภาคของอวัยวะเพศชายที่แข็งตัว